如果是明显此科目后期没用业务往来，比如应收应付中二级科目的某公司名称，将它改成其他公司可以吗？

如果公司的每年账套沿用的话，不建议随意删除科目，期初余额为零的科目是很正常的账务现象，随意删除会造成取数有问题，报表错乱。还有可能影响以前年度数据。